Los 39 resultados están confirmados por al menos dos fuentes (RSSSF, UEFA). Están solo los partidos de clubes españoles. Los resultados son los del final del partido (con alargue si lo hubo); en los historiales, los definidos por penales cuentan como empate.
Fuentes: UEFA · RSSSF 2015/16
Final
SevillaSemifinales (2 cruces)
SevillaIda
Sevilla3–1ShakhtarVuelta · Global 5-3: pasó Sevilla
Villarreal1–0LiverpoolIda
VillarrealVuelta · Global 3-1: pasó Liverpool
Cuartos de final (2 cruces)
Athletic Bilbao1–2SevillaIda
Sevilla1–2Athletic BilbaoVuelta · penales 5-4 para Sevilla
Villarreal2–1Sparta PrahaIda
VillarrealVuelta · Global 6-3: pasó Villarreal
Octavos de final (3 cruces)
Athletic Bilbao1–0
ValenciaIda
Valencia2–1Athletic BilbaoVuelta · Global 2-2 (goles de visitante): pasó Athletic Bilbao
SevillaIda
Sevilla3–0BaselVuelta · Global 3-0: pasó Sevilla
Villarreal2–0LeverkusenIda
VillarrealVuelta · Global 2-0: pasó Villarreal
Dieciseisavos de final (4 cruces)
Athletic BilbaoIda
Athletic Bilbao1–1MarseilleVuelta · Global 2-1: pasó Athletic Bilbao
Valencia6–0SK RapidIda
ValenciaVuelta · Global 10-0: pasó Valencia
Sevilla3–0MoldeIda
SevillaVuelta · Global 3-1: pasó Sevilla
Villarreal1–0NapoliIda
VillarrealVuelta · Global 2-1: pasó Villarreal
Fase de grupos
Athletic Bilbao3–1AugsburgAthletic BilbaoVillarrealVillarreal1–0SK RapidAthletic BilbaoAthletic Bilbao2–2AZ AlkmaarVillarreal1–0Viktoria PlzeňVillarrealAthletic BilbaoAthletic Bilbao5–1PartizanVillarreal4–0Dinamo-MinskVillarrealRepechaje
Athletic BilbaoIda
Athletic Bilbao1–0ŽilinaVuelta · Global 3-3 (goles de visitante): pasó Athletic Bilbao
Tercera ronda previa
Athletic Bilbao2–0ŞamaxıIda
Athletic BilbaoVuelta · Global 2-0: pasó Athletic Bilbao