109 de 110 resultados confirmados por dos fuentes; 1 queda ❗ a verificar (Wikipedia, ESPN, RSSSF). El campeón coincide con la lista oficial de finales. Los resultados son los del final del partido (con alargue si lo hubo); en los historiales, los definidos por penales cuentan como empate.
Fuentes: Wikipedia: 2008–09 Copa del Rey · ESPN
Final
Athletic Bilbao1–4
FC BarcelonaSemifinales (2 cruces)
Sevilla2–1Athletic BilbaoIda
Athletic Bilbao3–0SevillaVuelta · Global 4-2: pasó Athletic Bilbao
FC Barcelona2–0
MallorcaIda
Mallorca1–1FC BarcelonaVuelta · Global 3-1: pasó FC Barcelona
Cuartos de final (4 cruces)
Valencia3–2SevillaIda
Sevilla2–1ValenciaVuelta · pasó Sevilla; las fuentes no dicen cómo
Espanyol0–0FC BarcelonaIda
FC Barcelona3–2EspanyolVuelta · Global 3-2: pasó FC Barcelona
Athletic Bilbao0–0
Sporting GijónIda
Sporting Gijón1–2Athletic BilbaoVuelta · Global 2-1: pasó Athletic Bilbao
Mallorca1–0
Real BetisIda
Real Betis0–0MallorcaVuelta · Global 1-0: pasó Mallorca
Octavos de final (8 cruces)
Sevilla2–1
Deportivo de A CoruñaIda
Deportivo de A Coruña0–3SevillaVuelta · Global 5-1: pasó Sevilla
Sporting Gijón3–1
Real ValladolidIda
Real Valladolid2–1Sporting GijónVuelta · Global 4-3: pasó Sporting Gijón
Mallorca3–1
AlmeríaIda
Almería1–1MallorcaVuelta · Global 4-2: pasó Mallorca
Racing Santander1–1ValenciaIda
Valencia3–1Racing SantanderVuelta · Global 4-2: pasó Valencia
Atlético Madrid1–3FC BarcelonaIda
FC Barcelona2–1Atlético MadridVuelta · Global 5-2: pasó FC Barcelona
Osasuna1–1Athletic BilbaoIda
Athletic Bilbao2–0OsasunaVuelta · Global 3-1: pasó Athletic Bilbao
Dieciseisavos de final (15 cruces)
SD Ponferradina1–0SevillaIda
Sevilla4–0SD PonferradinaVuelta · Global 4-1: pasó Sevilla
Rayo Vallecano1–2AlmeríaIda
Almería3–0Rayo VallecanoVuelta · Global 5-1: pasó Almería
Celta Vigo2–2EspanyolIda
Espanyol3–0Celta VigoVuelta · Global 5-2: pasó Espanyol
CD Castellón0–2Real BetisIda
Real Betis2–0CD CastellónVuelta · Global 4-0: pasó Real Betis
Málaga1–1MallorcaIda
Mallorca2–0MálagaVuelta · Global 3-1: pasó Mallorca
Getafe0–0OsasunaIda
Osasuna1–0GetafeVuelta · Global 1-0: pasó Osasuna
Elche0–2Deportivo de A CoruñaIda
Deportivo de A Coruña2–0ElcheVuelta · Global 4-0: pasó Deportivo de A Coruña
CD Numancia0–1Sporting GijónIda
Sporting Gijón2–0CD NumanciaVuelta · Global 3-0: pasó Sporting Gijón
Tercera ronda (11 cruces)
Celta Vigo2–0
Real SociedadRayo Vallecano2–1
Albacete BalompiéElche1–1
CD Tenerifepenales 4-3 para Elche
Segunda ronda (22 cruces)
Real Sociedad1–0
Real Zaragoza
SD Huesca1–3Rayo Vallecanocon alargue
Real Oviedo2–3SD Ponferradinacon alargue
CD Castellón1–0
EibarElche2–0
Alavés
Gimnàstic de Tarragona0–2
GironaCD Tenerife2–1
Córdoba
Primera ronda (18 cruces)
SD Ponferradina1–0
Racing de Ferrolcon alargue
