60 de 133 resultados confirmados por dos fuentes; 73 quedan ❗ a verificar (Wikipedia, RSSSF). El campeón coincide con la lista oficial de finales. Los resultados son los del final del partido (con alargue si lo hubo); en los historiales, los definidos por penales cuentan como empate.
Fuentes: Wikipedia: 1998–99 Copa del Rey · ESPN
Final
Atlético Madrid0–3
ValenciaSemifinales (2 cruces)
Valencia6–0
Real MadridIda
Real Madrid2–1ValenciaVuelta · Global 7-2: pasó Valencia ❗ A verificar: solo está en Wikipedia.
Atlético Madrid0–0
Deportivo de A CoruñaIda
Deportivo de A Coruña0–1Atlético MadridVuelta · Global 1-0: pasó Atlético Madrid ❗ A verificar: solo está en Wikipedia.
Cuartos de final (4 cruces)
Racing Santander2–6Real MadridIda
Real Madrid1–0Racing SantanderVuelta · Global 7-2: pasó Real Madrid ❗ A verificar: solo está en Wikipedia.
Atlético Madrid2–1
EspanyolIda
Espanyol1–4Atlético MadridVuelta · Global 6-2: pasó Atlético Madrid ❗ A verificar: solo está en Wikipedia.
Mallorca1–1Deportivo de A CoruñaIda
Deportivo de A Coruña1–0MallorcaVuelta · Global 2-1: pasó Deportivo de A Coruña ❗ A verificar: solo está en Wikipedia.
FC Barcelona2–3ValenciaIda
Valencia4–3FC BarcelonaVuelta · Global 7-5: pasó Valencia ❗ A verificar: solo está en Wikipedia.
Octavos de final (8 cruces)
Real Madrid2–0
VillarrealIda
Villarreal0–2Real MadridVuelta · Global 4-0: pasó Real Madrid ❗ A verificar: solo está en Wikipedia.
Espanyol4–2
Real ValladolidIda
Real Valladolid2–2EspanyolVuelta · Global 6-4: pasó Espanyol
Celta Vigo0–1Deportivo de A CoruñaIda
Deportivo de A Coruña1–1Celta VigoVuelta · Global 2-1: pasó Deportivo de A Coruña
Athletic Bilbao2–2Racing SantanderIda
Racing Santander1–0Athletic BilbaoVuelta · Global 3-2: pasó Racing Santander ❗ A verificar: solo está en Wikipedia.
Levante0–3ValenciaIda
Valencia1–0LevanteVuelta · Global 4-0: pasó Valencia ❗ A verificar: solo está en Wikipedia.
Real Sociedad1–2Atlético MadridIda
Atlético Madrid0–1Real SociedadVuelta · pasó Atlético Madrid; las fuentes no dicen cómo ❗ A verificar: solo está en Wikipedia.
Real Betis0–1MallorcaIda
Mallorca1–0Real BetisVuelta · Global 2-0: pasó Mallorca ❗ A verificar: solo está en Wikipedia.
Cuarta ronda (6 cruces)
Deportivo de A Coruña1–1
Sporting GijónIda
Sporting Gijón0–1Deportivo de A CoruñaVuelta · Global 2-1: pasó Deportivo de A Coruña ❗ A verificar: solo está en Wikipedia.
Las Palmas0–1LevanteIda
Levante0–0Las PalmasVuelta · Global 1-0: pasó Levante
Racing Santander2–0
OsasunaIda
Osasuna1–0Racing SantanderVuelta · Global 2-1: pasó Racing Santander ❗ A verificar: solo está en Wikipedia.
Villarreal2–2
SevillaIda
Sevilla1–3VillarrealVuelta · Global 5-3: pasó Villarreal ❗ A verificar: solo está en Wikipedia.
Tercera ronda (12 cruces)
Las Palmas0–0
AlavésIda ❗ A verificar: solo está en Wikipedia.
Alavés2–2Las PalmasVuelta · pasó Las Palmas; las fuentes no dicen cómo ❗ A verificar: solo está en Wikipedia.
Sporting Gijón1–1
Real ZaragozaIda
Real Zaragoza2–2Sporting GijónVuelta · pasó Sporting Gijón; las fuentes no dicen cómo
Málaga1–2Real ValladolidIda ❗ A verificar: solo está en Wikipedia.
Real Valladolid3–2MálagaVuelta · Global 5-3: pasó Real Valladolid ❗ A verificar: solo está en Wikipedia.
CD Numancia0–1Racing SantanderIda
Racing Santander1–1CD NumanciaVuelta · Global 2-1: pasó Racing Santander
Segunda ronda (14 cruces)
FC Cartagena0–2LevanteIda
Levante4–1FC CartagenaVuelta · Global 6-1: pasó Levante ❗ A verificar: solo está en Wikipedia.
Cádiz1–3MálagaIda ❗ A verificar: solo está en Wikipedia.
Málaga3–0CádizVuelta · Global 6-1: pasó Málaga ❗ A verificar: solo está en Wikipedia.
Primera ronda (20 cruces)
Cádiz2–2
GranadaIda ❗ A verificar: solo está en Wikipedia.
Granada1–2CádizVuelta · Global 4-3: pasó Cádiz ❗ A verificar: solo está en Wikipedia.
Cultural y Deportiva Leonesa2–2CD NumanciaIda ❗ A verificar: solo está en Wikipedia.
CD Numancia1–1Cultural y Deportiva LeonesaVuelta · pasó CD Numancia; las fuentes no dicen cómo ❗ A verificar: solo está en Wikipedia.
