1 de 23 resultados confirmados por dos fuentes; 22 quedan ❗ a verificar (Wikipedia, RSSSF). El campeón coincide con la lista oficial de finales. Los resultados son los del final del partido (con alargue si lo hubo); en los historiales, los definidos por penales cuentan como empate.
Fuentes: Wikipedia: 1939 Copa del Generalísimo · ESPN
Final
Sevilla6–2
Racing de FerrolSemifinales (2 cruces)
Sevilla6–5
AlavésIda ❗ A verificar: solo está en Wikipedia.
Alavés1–1SevillaVuelta · Global 7-6: pasó Sevilla ❗ A verificar: solo está en Wikipedia.
Cuartos de final (4 cruces)
Racing de Ferrol3–1
Real SociedadIda ❗ A verificar: solo está en Wikipedia.
Real Sociedad0–0Racing de FerrolVuelta · Global 3-1: pasó Racing de Ferrol ❗ A verificar: solo está en Wikipedia.
Atlético Madrid2–0SevillaIda ❗ A verificar: solo está en Wikipedia.
Sevilla4–1Atlético MadridVuelta · Global 4-3: pasó Sevilla ❗ A verificar: solo está en Wikipedia.
Racing Santander2–5AlavésIda ❗ A verificar: solo está en Wikipedia.
Alavés2–1Racing SantanderVuelta · Global 7-3: pasó Alavés ❗ A verificar: solo está en Wikipedia.
Ronda de 12 (5 cruces)
Osasuna0–1
Real ZaragozaIda ❗ A verificar: solo está en Wikipedia.
Real Zaragoza3–1OsasunaVuelta · Global 4-1: pasó Real Zaragoza ❗ A verificar: solo está en Wikipedia.
Real Betis1–1Atlético MadridIda ❗ A verificar: solo está en Wikipedia.
Atlético Madrid4–0Real BetisVuelta · Global 5-1: pasó Atlético Madrid ❗ A verificar: solo está en Wikipedia.